漁業(yè)資源與生態(tài)系統(tǒng)研究室是黃海水產(chǎn)研究所創(chuàng)新體系的重要組成部分，是我國歷史最為悠久的海洋漁業(yè)資源研究機構和我國漁業(yè)聲學應用研究的發(fā)源地。主要研究領域包括漁業(yè)生物學基礎及其資源評估；種群動力學與資源補充機制；食物網(wǎng)與生態(tài)系統(tǒng)動力學；資源增殖理論與生態(tài)安全；海洋生態(tài)系健康與生態(tài)系統(tǒng)水平上的漁業(yè)管理；極地與遠洋漁業(yè)。近年來，承擔了國家973、863、公益性行業(yè)（農(nóng)業(yè)）科研專項、國家自然科學基金資助項目、國際合作等重大項目以及農(nóng)業(yè)部、山東省科研項目等，初步建立了具有顯著陸架特色的我國近海生態(tài)系統(tǒng)動力學理論體系，推動了國際GLOBEC研究的發(fā)展；建立了黃渤海不同水域的食物網(wǎng)模型，為漁業(yè)資源增殖容量與生態(tài)風險評估奠定了基礎；系統(tǒng)開展了我國專屬經(jīng)濟區(qū)和大陸架海洋生物資源與生物多樣性調查與評估，并依據(jù)分子生態(tài)學理論開發(fā)重要漁業(yè)生物種群甄別的分子技術，為海洋生物資源的保護、漁業(yè)管理做出了重要貢獻。

目前，實驗室在職科研人員31人，其中具高級職稱者16人；院士1人；中國水產(chǎn)科學研究院學科首席科學家1人；重點研究領域首席科學家1人；博士、碩士研究生導師8名，與多所大學聯(lián)合培養(yǎng)博士、碩士研究生。

重點任務：依據(jù)《中國水生生物資源養(yǎng)護行動綱要》確立的指導思想、基本原則和目標，針對目前我國水生生物資源利用與養(yǎng)護工作存在的突出問題，依托現(xiàn)有工作基礎，選擇對《綱要》有重大支撐作用的基礎性項目、在國內外能夠產(chǎn)生重大影響的項目、具有典型性和重大示范推廣作用的科研項目進行安排。通過漁業(yè)資源評估及其漁業(yè)生物學基礎、種群動力學與資源補充機制、食物網(wǎng)與生態(tài)系統(tǒng)動力學、資源增殖理論與生態(tài)安全、大海洋生態(tài)系健康與可持續(xù)開發(fā)管理等研究，增強我國水生生物資源養(yǎng)護能力，提高水生生物資源養(yǎng)護的管理和技術支撐水平，逐步建立并形成完善、科學、規(guī)范的水生生物資源養(yǎng)護體系，充分發(fā)揮各科研項目的生態(tài)、社會和經(jīng)濟效益，為今后全面開展水生生物資源養(yǎng)護工作奠定基礎。